Dés sa conception, ProjeQtOr a bénéficié d'attentions particulières au niveau de la performance et de la sécurité, pour un faire un outil performant, robuste et fiable.

La conception a commencé par la mise en oeuvre d'un Framework spécifique, capable de gérer la persistance de manière homogène, fiable et surtout simple.

La performance a aussi été prise en compte au travers de campagnes de tests et d'optimisations constantes.

La sécurité n'a pas été négligée en prenant en compte les règles élémentaires issues des constats de l'OWASP (Open Web Application Security Project).
Certain membre de la communauté ont aussi permis de renforcer cette sécurité par des audits avancés qui ont identifié certaines failles résiduelles, immédiatement colmatées.